Visão geral dos métodos de transcriptômica espacial. 1, método de microdissecção. 2, método de hibridização in situ . 3, método de sequenciação in situ . 4, método de captura in situ . 5, método in silico .[1]

A transcriptômica espacial é um termo abrangente para uma família de métodos para atribuir tipos de células (identificados pelas leituras de mRNA) às suas localizações nas seções histológicas. Este método também pode ser usado para determinar a localização subcelular de moléculas de mRNA. O termo é uma variação da Genômica Espacial, descrita pela primeira vez por Doyle, et al., em 2000[2] e depois expandida por Ståhl et al. al. em uma técnica[3] desenvolvida em 2016, que desde então passou por diversas melhorias e modificações.[3]

Referências

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  1. «BioRender». BioRender (em inglês). Consultado em 26 de fevereiro de 2021 
  2. US 7613571 
  3. a b Ståhl PL, Salmén F, Vickovic S, Lundmark A, Navarro JF, Magnusson J, et al. (julho de 2016). «Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics». Science. 353 (6294): 78–82. Bibcode:2016Sci...353...78S. PMID 27365449. doi:10.1126/science.aaf2403 
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Zarr (formato de dados)

(janeiro de 2025). «WebAtlas pipeline for integrated single-cell and spatial transcriptomic data». Nature Methods (em inglês) (1): 3–5. ISSN 1548-7091. doi:10

Análise espacial

formas que os dados podem assumir. Abler, R., J. Adams, and P. Gould (1971) Spatial Organization–The Geographer's View of the World, Englewood Cliffs, NJ:

Microbioma

(18 de novembro de 2015). «Prokaryotes in Subsoil—Evidence for a Strong Spatial Separation of Different Phyla by Analysing Co-occurrence Networks». Frontiers

Collembola

Mirte; Ylstra, Bauke; Van Straalen, Nico M.; Roelofs, Dick (2009). «Transcriptomics reveals extensive inducible biotransformation in the soil-dwelling

Neurônio olfatório

9677  Hanchate, Naresh K.; Kunio (4 de dezembro de 2015). «Single-cell transcriptomics reveals receptor transformations during olfactory neurogenesis». Science